Преподаватели


Козлов Константин Николаевич

к.биол.н.
с.н.с.

Руководство дипломными и выпускными работами

NСтудентГруппаКвалификация / СтепеньГодТема
1.Дымова Арина Викторовна63601/4 Магистр 2015 Математическая модель динамики экспрессии генов gap в эмбрионе плодовой мушки, учитываюшая сайты связывания транскрипционных факторов 
2.Мужиченко Владимир Владимирович63601/4 Магистр 2014 Решение обратной задачи математического моделирования динамики процесса детерминации сегментов у плодовой мушки дрозофила методом разностной эволюции 

Основные публикации

 
Статьи
NАвторыНазваниеИзданиеГод
1.Kozlov K., Gursky V., Kulakovskiy I., Dymova A., Samsonova M. Analysis of Functional Importance of Binding Sites in the Drosophila Gap Gene Network Model BMC Genomics, 16, Suppl 13: s7, 2015 2015 
2.Kozlov K., Chebotarov D., Hassan M., Triska P., Triska M., Flegontov P., Tatarinova T.  Differential Evolution Approach to Detect Recent Admixture BMC Genomics 2015, 16, p. S9  2015 
3.Козлов К.Н., Самсонов А.М., Самсонова М.Г.  Метод полностью параллельной разностной эволюции для адаптации моделей в системной биологии Биофизика, том 60, вып. 6, с.1219-1220  2015 
4.Ivanisenko N.V., Mishchenko E.L., Akberdin I.R., Demenkov P.S., Likhoshvai V.A., Kozlov K.N., Todorov D.I., Gursky V.V., Samsonova M.G., Samsonov A.M., Clausznitzer D., Kaderali L., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A. A new stochastic model for subgenomic hepatitis C virus replication considers drug resistant mutants PLoS One. 2014 Mar 18;9(3):e91502 2014 
5.Kozlov K., Gursky V., Kulakovsky I., Samsonova M. Sequence-Based Model of Gap Gene Regulatory NetworkBMC Genomics 2014,15(Suppl 12):S6 BMC Genomics 2014, 15(Suppl 12):S6 2014 
6.Myasnikova E., Kozlov K.N. Statistical method for estimation of the predictive power of a gene circuit modelJ Bioinform Comput Biol. 2014 Apr;12(2):1441002. doi: 10.1142/S0219720014410029 2014 
 
Доклады, тезисы и материалы конференций
NАвторыНазваниеИзданиеГод
1.Kozlov К. Analysis of functional importance of binding sites in the Drosophila gap gene network modelProceedings of the 7th Summer School on Systems Biology and Bioinformatics (SSB'2015), Novosibirsk, Russia, 22-25 June, устное выступление 2015 
2.Kozlov K. Differential Evolution Entirely Parallel Method for Sequence-based Modeling of Gene ExpressionECCB’2014, Strasbourg, France, 7-10 September 2014 
3.Terskikh A., Kozlov K. Quantitative characterization of receptor - mediated endocytosis by segmentation of confocal images2014 International German/Russian Workshop on Integrative Biological Pathway Analysis and Simulation.A satellite meeting of the International Conference of Integrative Bioinformatics , June 2nd to 3rd, 2014 Bielefeld, Germany, Report 2014, 55-57  2014 
4.Kozlov К. Sequence-based model of gap gene regulatory networkIn Proceedings of the 9th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure.Systems Biology (BGRS\SB’2014), Novosibirsk,Russia, 23-28 June 2014 
5.Gursky V., Kozlov K., Kulakovsky I., Nuzhdin S. Systems approach for construction of genotype-phenotype mapIV Международная научно-практическая конференция “Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине”Казань, Россия, 29 октября - 1 ноября 2014 
6.Ivanisenko N.V., Mischenko E.L.,Akberdin I.R., Demenkov P.S., Likhoshvai V.A., Samsonov A.M., Kozlov K.N., Todorov D.I., Gursky V.V., Samsonova M.G., Clausnitzer D., Kaderali L., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A. The intracellular molecular mechanisms for HCV drug resistance emergenceIV Международная научно-практическая конференция “Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине”Казань, Россия, 29 октября - 1 ноября 2014